臺北永樂町人，被喻為「臺灣山岳畫家」。師從當時同為日本獨立美術協會會員的林重義、伊藤廉，故畫風屬於日本學院的寫實主義。1936年回到神戶，1937年在廈門美專舉辦個展，後被總督府召回臺灣，與張萬傳、洪瑞麟、陳德旺等人創立了「MOUVE美術集團」(即後來的「台灣造型美術協會」)。1946年在省展開幕獲得特選長官賞。並進入編譯館任助理編輯，製作教科書插畫。二二八後，轉任教育廳編審會。1948年，組織「青雲畫會」，並開辦第一回展覽。
呂基正擅長利用畫刀與畫筆，增添豐富的色調層次與肌理變化，藉此產生活絡的動感與生命力。同時，在速寫草圖與大幅油畫間保留了廣闊的表現空間，讓他得以在畫面上自由地發揮個人的感受，這或許就是伊藤廉評價他的山嶽繪畫作，有「一層東方人特有的精神與內涵」的原因之一。在繪畫主題上，呂基正自戰後起，便開始描繪臺灣的山嶽。他以臺灣四季高山為主題，用粗獷的筆觸、大膽的方式表現山嶽的雄姿。他所描繪的場景眾多，其中包括初雪、小雪、殘雪、初春、盛夏等，也有山上特有的雲湧、雲漫等。